Infecția cu rotavirus și coccidioza sunt cauzele majore ale diareei înainte de înțărcare. Alți agenți precum E. coli poate fi implicat pe măsură ce protecția colostrală scade sau când sunt întâlnite noi tulpini și clostridiile pot coloniza intestinele deteriorate de alți agenți.De asemenea, pot apărea gastroenterită transmisibilă (TGE) și diareea epidemică porcină (PED). Grupele de rotavirus A, BC și E au fost găsite la porci, dar grupa A este de obicei primul care infectează un purcel și este cel mai frecvent în diareea de dinainte de înțărcare. Rotavirusurile sunt relativ rezistente, supraviețuiesc 7-9 luni la 18-20˚C și sunt stabile între pH 3 și 9. Infecția apare la purceii care nu au luat colostru și când anticorpii materni din lapte scade de la 2 săptămâni încolo. Infecția este orală și virusul se repetă în celulele care căptușesc intestinul subțire mijlociu de la jejunul superior la ileonul inferior. Celulele mature absorbante sunt eliminate și rezultă atrofia vilozității. Eșecul rezultat de a absorbi nutrienții duce la diaree care conține particule de virus. Recuperarea poate fi completă în 7 zile.