Cercetătorii de la Waltham Petcare Science Institute din Marea Britanie au creat un catalog complet al microbiomului intestinal al câinilor, după analiza probelor prelevate de la 107 câini sănătoși din SUA și Europa. Studiul, publicat în jurnalul Microbiome, a identificat numeroase tulpini bacteriene noi și rolul acestora în sănătatea intestinului, oferind acum cea mai detaliată resursă pentru cercetarea microbiomului la animalele de companie.

Lipsa datelor despre microbiomul animalelor de companie

Deși interesul pentru microbiom a crescut în rândul oamenilor de știință și al publicului larg, cercetările asupra microbiomului animalelor de companie, cum ar fi câinii și pisicile, sunt încă limitate. Majoritatea studiilor s-au concentrat pe microbiomul uman și, într-o măsură mai mică, pe microbiomul animalelor din agricultură. Deoarece există suprapuneri între unele bacterii din intestinul oamenilor și al câinilor, cercetările anterioare au analizat mai mult asemănările cu microbiomul uman decât funcțiile specifice ale microbiomului canin și legătura acestora cu sănătatea câinilor.

Aceasta a lăsat un gol important în cunoașterea taxonomiei și funcției microbiomului canin, pe care echipa de cercetare a urmărit să îl completeze. Ei spun că o mare parte din microbiomul câinilor rămâne necunoscut, doar aproximativ 25% dintre secvențele metagenomice canine putând fi asociate cu genomuri deja cunoscute, potrivit autorilor studiului.

„Fără o bază de date mai detaliată, care să includă descoperirea de specii noi și descrierea rolurilor acestor organisme, concentrându-ne pe gazdă, înțelegerea microbiomului canin este limitată”, au explicat autorii studiului.

O privire detaliată asupra microbiomului câinilor sănătoși

Câinii incluși în studiu proveneau din mai multe țări și medii diferite, inclusiv facilități de tip kennel la Waltham Petcare Science Institute și Pet Health and Nutrition Center, precum și din casele angajaților și clienților Mars Petcare. Cercetătorii au folosit 501 probe fecale și au aplicat secvențiere metagenomică atât pe termen scurt, cât și pe termen lung.

În urma analizei, au fost reconstruite 5.753 de genomuri metagenomice asamblate (MAG), care au fost apoi reduse la 1.031 de tulpini unice. Dintre acestea, 982 au fost tulpini specifice câinilor, 89 au fost specii noi, iar 10 au fost genuri noi. Rata de mapare a secvențelor a crescut semnificativ, de la aproximativ 25% la 95%.

Cea mai abundentă specie identificată a fost Prevotella copri, reprezentând 8,1% din microbiom, bacterie care este, de asemenea, cea mai frecventă în intestinul oamenilor. Unele dintre speciile noi identificate au roluri importante în metabolizarea carbohidraților, producerea acizilor grași cu lanț scurt și a vitaminelor, precum și în metabolismul acizilor biliari.

Toate speciile descoperite trăiesc în intestin fără a afecta gazda, nici negativ, nici pozitiv. Cercetătorii au subliniat că absența patogenilor este de așteptat, având în vedere că studiul a implicat doar câini sănătoși.

Rezultatele studiului oferă o resursă valoroasă pentru cercetarea modificărilor microbiomului în cazul bolilor, îmbătrânirii sau a intervențiilor dietetice și permit dezvoltarea mai precisă a probioticelor, prebioticelor și a strategiilor alimentare pentru câini. De asemenea, oferă un punct de referință pentru rezistența la antimicrobiene la câinii sănătoși.

Articol: Juan Castillo-Fernandez et al, Waltham catalogue for the canine gut microbiome: a complete taxonomic and functional catalogue of the canine gut microbiome through novel metagenomic based genome discovery, Microbiome (2026). DOI: 10.1186/s40168-025-02265-w

Sursa: phys.org