Cancerul colorectal este a doua cauză de mortalitate prin cancer la nivel mondial. Detectarea precoce permite tratamente eficiente, dar colonoscopia – metoda principală de diagnostic – este costisitoare și incomodă, ceea ce duce adesea la întârzieri în stabilirea diagnosticului.

O echipă de la Universitatea din Geneva (UNIGE) a folosit algoritmi de învățare automată pentru a realiza pentru prima dată un inventar detaliat al tuturor bacteriilor intestinale umane, la nivel de subspecii. Această clasificare mai fină permite înțelegerea rolului fiziologic al diferitelor grupuri microbiene. Pe baza acestui inventar, cercetătorii au reușit să identifice prezența cancerului colorectal prin analiza simplă a unei probe de scaun, o metodă neinvazivă și cu costuri reduse. Rezultatele au fost publicate în revista Cell Host & Microbe.

Mirko Trajkovski, profesor la Facultatea de Medicină a UNIGE, a explicat că subspeciile bacteriene oferă o rezoluție suficient de specifică pentru a arăta diferențele funcționale legate de boală, dar și suficient de generală pentru a fi aplicată la grupuri diferite de persoane și regiuni.

Primul pas al studiului a fost analiza unui volum foarte mare de date. Matija Trickovic, doctorand în laboratorul condus de Trajkovski și primul autor al lucrării, a declarat că provocarea a fost dezvoltarea unei metode eficiente pentru analizarea acestor date și că echipa a reușit să creeze primul catalog complet al subspeciilor din microbiota intestinală umană, alături de o metodă precisă de utilizare a acestuia în cercetare și clinică.

Combinând acest catalog cu date clinice existente, cercetătorii au dezvoltat un model capabil să detecteze cancerul colorectal doar pe baza bacteriilor din scaun. „Deși eram încrezători în strategie, rezultatele au fost surprinzătoare”, a spus Trickovic. Metoda a reușit să identifice 90% dintre cazuri, un procent apropiat de rata de 94% obținută prin colonoscopie și mai bun decât metodele neinvazive folosite în prezent.

Modelul ar putea deveni și mai precis odată ce va fi alimentat cu mai multe date clinice, apropiindu-se astfel de acuratețea colonoscopiei. Aceasta ar putea fi folosită ca metodă de screening de rutină, urmând ca colonoscopia să confirme diagnosticul doar pentru un grup selectat de pacienți.

Un prim studiu clinic este pregătit în colaborare cu Spitalele Universitare din Geneva, pentru a determina mai exact stadiile cancerului și tipurile de leziuni detectabile. Trajkovski a adăugat că aceeași metodă ar putea fi utilizată pentru dezvoltarea unor instrumente neinvazive de diagnostic și pentru alte boli, pornind de la o singură analiză a microbiotei.

Sursa: sciencedaily.com